הבדלים בין גרסאות בדף "רפואה מותאמת אישית בסרטן מעי גס גרורתי"
(14 גרסאות ביניים של אותו משתמש אינן מוצגות) | |||
שורה 2: | שורה 2: | ||
{{מחלה | {{מחלה | ||
− | |תמונה= | + | |תמונה=[[קובץ:Stomach colon rectum diagram.svg|250px]] |
− | |כיתוב תמונה= | + | |כיתוב תמונה=Diagram of the stomach, colon, and rectum |
− | |שם עברי= | + | |שם עברי=רפואה מותאמת אישית בסרטן המעי הגס |
|שם לועזי= | |שם לועזי= | ||
|שמות נוספים= | |שמות נוספים= | ||
− | |ICD-10= | + | |ICD-10={{ICD10|C|18||c|15}}-{{ICD10|C|20||c|15}}/{{ICD10|C|21||c|15}} |
− | |ICD-9= | + | |ICD-9={{ICD9|153.0}}-{{ICD9|154.1}} |
|MeSH= | |MeSH= | ||
− | |יוצר הערך= | + | |יוצר הערך=פרופ' אירית בן-אהרון |
|אחראי הערך= | |אחראי הערך= | ||
− | }} | + | }} |
− | {{הרחבה|סרטן מעי גס גרורתי}} | + | {{הרחבה|ערכים=[[סרטן מעי גס גרורתי]], [[רפואה מותאמת אישית]]}} |
− | + | ==מבוא== | |
− | + | חידושים בטיפול בסרטן מעי גרורתי הביאו לשיפור משמעותי בשרידות החולים - משרידות חציונית של 12 חודשים בפרוטוקול מבוסס FU{{כ}}-5, ועד לשרידות חציונית של למעלה מ-30 חודשים במשלבי [[כימותרפיה]] בשילוב תרופות מכוונות מטרה, דוגמת מעכבי הקולטן ל-EGFR או מעכבי אנגיוגנזה. ואולם מחקר ענף שמתחקה אחר הביולוגיה של גידולי המעי חושף הבדלים ביולוגיים משמעותיים בין תתי-אוכלוסיות של סרטן המעי שהם בעלי משמעות הן לגבי התגובה לטיפול והן לגבי הפרוגנוזה של המחלה. | |
− | |||
+ | "רפואה מותאמת אישית", או בלועזית personalized medicine, היא מונח המתאר ניסיון לתפור (tailor) טיפול לפי המאפיינים הביולוגיים הייחודיים לכל חולה, והיא הפכה במידה מסוימת למציאות יומיומית בהיבטים טיפוליים מסוימים, דוגמת מתן מעכבי הקולטן ל-EGFR רק בגידולים שאינם מבטאים מוטציה ל-RAS או אימונותרפיה לגידולים בעלי דרגה גבוהה של חוסר יציבות גנומית (High microsatellite instability - MSI-H). סטטוס MSI ו-RAS נבדקים כחלק מהפרקטיקה הקלינית בגידולי סרטן מעי גרורתיים, לצורך התאמת הטיפול, והם מעוגנים בהנחיות האיגודים הקליניים {{הערה|שם=הערה1|National Comprehensive Cancer Network (NCCN). NCCN Clinical Practice Guidelines in Oncology. Colon Cancer (Version 2.2017). 2017 Mar 13; National Comprehensive Cancer Network. Available from: https://www.nccn.org/professionals/physician_ gls/PDF/colon.pdf}}. אולם מאפיינים ביולוגיים אלה (ביומרקרים) אינם מנבאים כי הטיפול יהיה בהכרח יעיל, וישנם חולים שמגיבים לטיפולים באופן לא אופטימלי למרות היותם מועמדים מתאימים לפי סטטוס הביומרקרים. | ||
+ | לפיכך קיים ניסיון מתמיד להתחקות אחר הפרופיל הגנומי של השאת, שעשוי לשקף באופן פרטני מוטציות ספציפיות בגידול של חולה מסוים, שיכולות להגיב לטיפול מכוונן מטרה הפועל במסלול תאי זה. קיים שינוי תפיסתי מהבדיקה הפתולוגית הקלאסית, שבודקת חלבון או גן בודד כאתר פעולה אפשרי, לתרופה בודדת (מודל one test - one drug) לבדיקות גנומיות מורכבות שעושות שימוש בטכנולוגיות של ריצוף מהדור החדש (Next Generation Sequencing - NGS) במעבדות דיאגנוסטיות קליניות. | ||
− | |||
− | |||
− | |||
− | |||
− | |||
− | |||
הטמעת מודל "רפואה מותאמת אישית גנומית" בקליניקה כרוכה באתגרים רבים, בהם: | הטמעת מודל "רפואה מותאמת אישית גנומית" בקליניקה כרוכה באתגרים רבים, בהם: | ||
− | + | *עלויות גבוהות לבדיקות | |
− | + | *סטנדרטיזציה של איכות הבדיקות (ברמת הריצוף, הפקת החומר הגנומי והיבטים טכניים כמו איסוף ואחסון הדגימות) | |
− | + | *סוגיות אתיות העולות כתוצאה מבדיקות גנטיות, הן פועל יוצא מתוצאות הבדיקה הגנומית. השאלה העיקרית המתבקשת וטרם התקבל עבורה מענה: האם טיפול מכוון מטרה המותאם לפרופיל המוטציות של הגידול הפרטני אכן מיתרגם לשיפור בשרידות המטופל | |
+ | |||
ההתפתחות בהבנת הביולוגיה של גידולי המעי הגס סללה את הדרך לגישה מותאמת אישית. לעומתה, הגישה המסורתית מבוססת על עדויות מחקריות לתועלת הטיפול על סמך מאפייני גידול פתולוגיים דומים בקבוצות חולים, ללא אבחנה בשוני פוטנציאלי בפרופיל הגנומי של הגידולים, שעשוי להכתיב תגובה שונה לטיפול. | ההתפתחות בהבנת הביולוגיה של גידולי המעי הגס סללה את הדרך לגישה מותאמת אישית. לעומתה, הגישה המסורתית מבוססת על עדויות מחקריות לתועלת הטיפול על סמך מאפייני גידול פתולוגיים דומים בקבוצות חולים, ללא אבחנה בשוני פוטנציאלי בפרופיל הגנומי של הגידולים, שעשוי להכתיב תגובה שונה לטיפול. | ||
− | |||
− | |||
− | |||
− | |||
− | |||
− | |||
− | + | ==הבדלים במאפיינים הגנומיים של הגידול== | |
− | ועם חלוף הזמן ועליית זמינות בדיקות אלה הן עשויות להפוך לכלי היעיל והכלכלי ביותר לבדיקת ביומרקרים MSI- | + | סרטן המעי הוא מחלה מורכבת והטרוגנית, שהאטיולוגיה שלה נעוצה במספר מסלולים תאיים אפשריים, גם נוכח מופע היסטולוגי דומה. הבדל זה בפרופיל הגנומי של הגידול שאיננו מתבטא בתצורה ההיסטופתולוגית, עשוי להסביר התפתחותו של מהלך ביולוגי שונה לאורך ציר הזמן בחולים שאצלם קיים דמיון במראה ההיסטופתולוגי של הגידול ושוני במהלך הקליני ובתגובות לטיפולים השונים{{הערה|שם=הערה2|Deschoolmeester V, Baay M, Specenier P, et al. A review of the most promising biomarkers in colorectal cancer: one step closer to targeted therapy. Oncologist. 2010;15(7):699-731. Epub 2010 Jun 28.}}. |
− | בדיקות אלה מספקות כמויות מידע אדירות, אלא שברובן לא ברורה חשיבותן הקלינית, ולכן הן אינן יכולות להחליף את המערכת המקובלת להערכת יעילות הטיפול הקליני - רפואה נתמכת ראיות (Evidence Based Medicine - EBM), אלא לשמש כחלופה נוספת | + | |
− | שילוב NGS עם מחקרים קליניים | + | פרויקט אטלס גנום הסרטן (The Cancer Genome Atlas, TCGA) הגדיר את המסלולים התאיים הבולטים המעורבים בפתוגנזה של סרטן המעי הגס - לדוגמה, ביטוי יתר של האונקוגן MYC, ושל גנים במסלול WNT, ושינויים ב-[[KRAS]]{{כ}}, BRAF או NRAS בשילוב עם שינויים במסלול PI3K{{כ}}{{הערה|שם=הערה3|Cancer Genome Atlas Network. Comprehensive molecular characterization of human colon and rectal cancer. Nature. 2012 Jun 18;487(7407):330-7.}}. בהמשך מופו ארבע תתי-קבוצות שונות של גידולי סרטן מעי (consensus molecular types), בעלי ביולוגיה ייחודית ומסלולים תאיים בולטים שעומדים בבסיס הפתולוגיה של כל תת-קבוצה. בין הקבוצות נצפה מהלך ביולוגי שונה, המתבטא בשינויים בשרידות הכוללת, שכיחות מוגברת של מוטציות מסוגים מסוימים ותגובה שונה לטיפולים מכווני מטרה {{הערה|שם=הערה4|Guinney J, Dienstmann R, Wang X, et al. The consensus molecular subtypes of colorectal cancer. Nat Med. 2015 Nov;21(11):1350-6. Epub 2015 Oct 12.}}, כך נמצא כי תת-קבוצה אחת מבטאת אברציות במסלול HER2 בשכיחות גבוהה יותר, בתת קבוצה אחרת שכיחות MSI-H מוגברת ודומה. |
− | + | ||
− | המתאימים לטיפול על סמך ביומרקרים אלה. כך לדוגמה, במחקרים | + | ==NGS - מהפכה במחקר הגנומי== |
− | NGS והעמקת המחקר התרגומי | + | הבדיקות הגנומיות בטכנולוגיות ריצוף מהדור החדש (NGS), מהוות מהפכה במחקר הגנומי, ועם חלוף הזמן ועליית זמינות בדיקות אלה הן עשויות להפוך לכלי היעיל והכלכלי ביותר לבדיקת ביומרקרים כ-MSI ו-RAS כחלק מהשגרה הקלינית הסטנדרטית, במקביל לבדיקת גנים נוספים באותו המעמד. אולם במגוון מעבדות הבדיקות אמנם נעשות בטכנולוגיה דומה, אך בשינויים מתודולוגיים. על כן, לצורך הטמעת טכנולוגיות אלה כחלק משגרת הטיפול, יש לוודא מעבר לכל ספק כי הבדיקות מאושררות ועוברות תהליך רשמי של תיקוף (ולידציה). הביואינפורמטיקה הנלווית לתהליך זה ומספקת את ניתוח הנתונים והתוצאות היישומיות של הבדיקה, מחויבת להיות ברמה גבוהה ומקצועית. רצף המוטציות המאופיינות בבדיקות NGS נע בין פנל של כמה עשרות גנים לפנל רחב של גנים הנחשבים מכוונים (targetable/ actionable) או גנים מדכאי גידול (Tumor Suppressor Genes). |
− | טכנולוגיות | + | |
− | ממד נוסף | + | בדיקות אלה מספקות כמויות מידע אדירות, אלא שברובן לא ברורה חשיבותן הקלינית, ולכן הן אינן יכולות להחליף את המערכת המקובלת להערכת יעילות הטיפול הקליני - רפואה נתמכת ראיות (Evidence Based Medicine - EBM), אלא לשמש כחלופה נוספת. |
− | ללמוד על תהליך זה בעיקר מביופסיה נוזלית (ctDNA) יותר מאשר מביופסיית רקמה | + | |
− | סיכום | + | ==שילוב NGS עם מחקרים קליניים== |
− | ההתפתחות האדירה בחקר הביולוגיה של הסרטן, בייחוד בתחום הגנטי, האפיגנטי והמולקולרי, היא בעלת פוטנציאל רב לטיוב הטיפול בסרטן המעי ובהמשך לזיהוי מוקדם לפי ביומרקרים עתידיים, מטכנולוגיות NGS בדם ואף בצואה | + | שילוב מחקרים קליניים הקלאסיים עם טכנולוגיית הריצוף מהדור החדש הוא כלי עזר המסייע להגדיר במדויק את פרופיל החולים המגיבים לטיפול במחקרים הקליניים. במחקרים רבים, קיים אלמנט של מחקר תרגומי המתבסס על טכנולוגיית הריצוף מהדור החדש ומספק פרופיל גנומי לחולים המשתתפים במחקר. כך ניתן לרבד באופן מדויק יותר את הפרופיל הביולוגי של החולים ולמצוא את הקורלציה לתגובה לטיפול שתאפשר לבחור את החולים המתאימים לטיפול על סמך ביומרקרים אלה. כך לדוגמה, במחקרים שבודקים את תועלת האימונותרפיה, הוטמע אלמנט זה של ריצוף, מכיוון שטיבה הביולוגי של קבוצת החולים שמפיקה תועלת מאימונותרפיה לוט בערפל. מעבר לסטטוס מוגבר של MSI, ומחקרים המעידים על התאמה בין ריבוי מוטציות ליעילות האימונותרפיה, עדיין לא התבססו ביומרקרים נוספים מוכחים כאינדיקטורים ליעילות הטיפול. לכן, אפיון מולקולרי וגנומי של אוכלוסיית המשתתפים במחקר עשוי לשפוך אור על האוכלוסייה המגיבה לטיפול והאוכלוסייה העמידה בפניו. |
− | + | ||
+ | ==NGS והעמקת המחקר התרגומי== | ||
+ | טכנולוגיות ה-NGS מאפשרות להעמיק את המחקר התרגומי ברובד נוסף, והוא ההתחקות אחר עמידות המתפתחת לטיפול או שינוי המתפתח בביטוי הגנים במהלך הטיפולים. ניתן לבצע את ה-NGS מרקמת גידול אך גם מ"ביופסיה נוזלית" - מדנ"א גידולי (ctDNA - Circulating Tumor DNA) המופרש לזרם הדם הסיסטמי ומופק מדם החולה. באופן זה הביופסיה הנוזלית מאפשרת בדיקה זמינה ולא חודרנית, שניתן לבצע במספר מועדים על ציר הזמן הטיפולי, במטרה ללמוד על שינויים בפרופיל הגנומי העשויים לשקף מנגנוני עמידות לטיפולים מכווני מטרה, דוגמת מעכבי EGFR או HER2{{הערה|שם=הערה5|Siravegna G, Mussolin B, Buscarino M, et al. Clonal evolution and resistance to EGFR blockade in the blood of colorectal cancer patients. Nat Med. 2015 Jul;21(7):795-801. Epub 2015 Jun 1.}} {{הערה|שם=הערה6|Misale S, Arena S, Lamba S, et al. Blockade of EGFR and MEK intercepts heterogeneous mechanisms of acquired resistance to anti-EGFR therapies in colorectal cancer. Sci Transl Med. 2014 Feb 19;6(224):224ra26.}} {{הערה|שם=הערה7|Bettegowda C, Sausen M, Leary RJ, et al. Detection of circulating tumor DNA in early- and late-stage human malignancies. Sci Transl Med. 2014 Feb 19;6(224):226-232.}}. | ||
+ | |||
+ | ממד נוסף הוא ההטרוגניות של הגידול, שרלוונטית גם לעניין העמידות לטיפול. ניתוח מקיף של ה-NGS מאפשר לחשוף הבדלים גנומיים משמעותיים בין גידולי מעי שונים באותו החולה עצמו. בגידולי ריאה, למשל, הוכח כי נוכחות של תת-אוכלוסייה תאית בגידול, שהיא בעלת מוטציה T790M, מנבאת תגובה פחותה למעכבי EGFR כקו טיפולי ראשון. בגידולי מעי, מוטציה ב-RAS עשויה לנבוע מתת-אוכלוסייה קטנה בגידול המקורי טרם התחלת הטיפול, או כתוצאה מתהליך מוטגנזה במהלך הטיפול מכוון המטרה במעכב EGFR. ממספר מחקרים עולה כי ניתן ללמוד על תהליך זה בעיקר מביופסיה נוזלית (ctDNA) יותר מאשר מביופסיית רקמה {{הערה|שם=הערה8|Russo M, Siravegna G, Blaszkowsky LS, et al. Tumor heterogeneity and lesion-specific response to targeted therapy in colorectal cancer. Cancer Discov. 2016 Feb;6(2):147-53. Epub 2015 Dec 7.}}. בבדיקות עוקבות במהלך הטיפולים עולים גם המסלולים התאיים שנלווים לפיתוח העמידות לטיפול, ומסלולים אלה מהווים אתר פעולה לטיפול התערבותי מחקרי במטרה להקטין את הסיכון להתפתחות העמידות לטיפול. כך לדוגמה בגידולים שמפתחים עמידות למעכב EGFR, השימוש במעכבי ERK או MEK עשוי להקטין את התנגודת למעכב זה {{הערה|שם=הערה5}} {{הערה|שם=הערה9|Montagut C, Dalmases A, Bellosillo B, et al. Identification of a mutation in the extracellular domain of the Epidermal Growth Factor Receptor conferring cetuximab resistance in colorectal cancer. Nat Med. 2012 Jan 22;18(2):221-3.}}. | ||
+ | |||
+ | ==סיכום== | ||
+ | ההתפתחות האדירה בחקר הביולוגיה של הסרטן, בייחוד בתחום הגנטי, האפיגנטי והמולקולרי, היא בעלת פוטנציאל רב לטיוב הטיפול בסרטן המעי ובהמשך לזיהוי מוקדם לפי ביומרקרים עתידיים, מטכנולוגיות NGS בדם ואף בצואה {{הערה|שם=הערה10|Gonzalez-Gonzalez M, Garcia JG, Montero JA, et al. Genomics and proteomics approaches for biomarker discovery in sporadic colorectal cancer with metastasis. Cancer Genomics Proteomics. 2013 Jan-Feb;10(1):19-25.}}. אפיון הפרופיל הפרטני של המטופל יאפשר לנקוט בעתיד גישה טיפולית אישית, המתבססת על ה"חותמת המולקולרית" הספציפית של הגידול. טכנולוגיות הריצוף הגנומי מספקות תמונה כוללנית על מוטציות שעומדות בבסיס הפתוגנזה של סרטן המעי הגס (driver mutations). | ||
− | + | טכנולוגיות אלה יהפכו דומיננטיות יותר ויותר בשנים הקרובות, ככל שמחירן יוזל ומערכות האנליזה תהיינה זמינות, אמינות ומהירות יותר, ובייחוד עם הפיכתן לחלק אינטגרלי מהמחקרים הקליניים החדשים - מה שיכול לייעל את הסקת המסקנות לגבי תת-אוכלוסיות של חולים שמפיקים את מרב התועלת מהטיפול המחקרי. הדרך לרפואה מותאמת אישית עדיין רצופה מהמורות רבות, בעיקר בתיקוף של הבדיקות, במהימנות הביומרקרים המתקבלים ובשאלה אם אכן "טיפול תפור לפי מידה" מיתרגם לשיפור בשרידות החולה, כפי שהגיוני לשער מבחינה ביולוגית, אולם ההוכחה לכך עדיין אינה חד-משמעית. רפואה מותאמת אישית היא מונח הכורך בתוכו רבדים שונים - החל בפרקטיקה של התאמת טיפול לפי מרקרים ידועים ומוכחים, וכלה בטיפולים ניסיוניים שניתן להתאים לחולה לפי פרופיל המוטציות האישי שמתקבל. ריצוף מהדור החדש הוא בעל ערך רב באפיון פרופיל המוטציות של הגידול, כשבדיקה מזהה מוטציה שעשויה לאפשר לחולה להשתתף במחקר הבודק טיפול במסלול תאי זה, ללא קשר לסוג הגידול (מחקרי "סל", Basket Trials) או במצבים בהם קווי הטיפול המוכחים מוצו הוא יוכל לספק כיוון טיפולי יצירתי שעלה רק לאור תוצאות בדיקה זו. | |
+ | מחקר שמבצע המכון הלאומי לסרטן בארצות הברית (National Cancer Institute), בודק אם האפיון האינדיבידואלי של פרופיל המוטציות של גידולים שונים, ומתן טיפול בהתאם לתוצאה, אכן מיתרגם לשינוי בתוחלת חייו של המטופל. עד לקבלת תשובות לשאלה מורכבת זו, רפואה מותאמת אישית מתקיימת רק באופן מוגבל, ובשילוב המתחייב עם רפואה נתמכת ראיות, המגובה במחקרים קליניים פרוספקטיביים שעדיין קובעים, את הפרקטיקה הטיפולית. | ||
− | + | ==ביבליוגרפיה== | |
+ | {{הערות שוליים|יישור=שמאל}} | ||
− | + | ==קישורים חיצוניים== | |
− | במה | + | * [http://www.cancer.org.il/download/files/Book%20bama_2017_web.pdf במה] עמ' 100 |
+ | {{ייחוס|פרופ' אירית בן-אהרון - המכון האונקולוגי, מרכז הסרטן ע"ש דוידוף, המרכז הרפואי רבין; הפקולטה לרפואה, אוניברסיטת תל אביב }} | ||
− | |||
− | |||
− | |||
− | |||
− | |||
− | + | <center>'''פורסם בכתב העת "במה", ינואר 2018, גיליון מס' 22, [[האגודה למלחמה בסרטן]]'''</center> | |
− | |||
− | + | [[קטגוריה:אונקולוגיה]] | |
− | + | [[קטגוריה:גסטרואנטרולוגיה]] | |
− | + | [[קטגוריה:משפחה]] | |
− | + | [[קטגוריה:פנימית]] | |
− | |||
− | |||
− | |||
− | |||
− | |||
− | |||
− | |||
− | |||
− | |||
− | |||
− |
גרסה אחרונה מ־05:52, 31 בדצמבר 2021
ערך זה נמצא בבדיקה ועריכה על ידי מערכת ויקירפואה, וייתכן כי הוא לא ערוך ומוגה.
רפואה מותאמת אישית בסרטן המעי הגס | ||
---|---|---|
' | ||
![]() | ||
Diagram of the stomach, colon, and rectum
| ||
ICD-10 | Chapter C 18.-Chapter C 20./Chapter C 21. | |
ICD-9 | 153.0 | |
יוצר הערך | פרופ' אירית בן-אהרון | |
לערכים נוספים הקשורים לנושא זה, ראו את דפי הפירושים: – סרטן מעי גס גרורתי, רפואה מותאמת אישית
מבוא
חידושים בטיפול בסרטן מעי גרורתי הביאו לשיפור משמעותי בשרידות החולים - משרידות חציונית של 12 חודשים בפרוטוקול מבוסס FU-5, ועד לשרידות חציונית של למעלה מ-30 חודשים במשלבי כימותרפיה בשילוב תרופות מכוונות מטרה, דוגמת מעכבי הקולטן ל-EGFR או מעכבי אנגיוגנזה. ואולם מחקר ענף שמתחקה אחר הביולוגיה של גידולי המעי חושף הבדלים ביולוגיים משמעותיים בין תתי-אוכלוסיות של סרטן המעי שהם בעלי משמעות הן לגבי התגובה לטיפול והן לגבי הפרוגנוזה של המחלה.
"רפואה מותאמת אישית", או בלועזית personalized medicine, היא מונח המתאר ניסיון לתפור (tailor) טיפול לפי המאפיינים הביולוגיים הייחודיים לכל חולה, והיא הפכה במידה מסוימת למציאות יומיומית בהיבטים טיפוליים מסוימים, דוגמת מתן מעכבי הקולטן ל-EGFR רק בגידולים שאינם מבטאים מוטציה ל-RAS או אימונותרפיה לגידולים בעלי דרגה גבוהה של חוסר יציבות גנומית (High microsatellite instability - MSI-H). סטטוס MSI ו-RAS נבדקים כחלק מהפרקטיקה הקלינית בגידולי סרטן מעי גרורתיים, לצורך התאמת הטיפול, והם מעוגנים בהנחיות האיגודים הקליניים [1]. אולם מאפיינים ביולוגיים אלה (ביומרקרים) אינם מנבאים כי הטיפול יהיה בהכרח יעיל, וישנם חולים שמגיבים לטיפולים באופן לא אופטימלי למרות היותם מועמדים מתאימים לפי סטטוס הביומרקרים.
לפיכך קיים ניסיון מתמיד להתחקות אחר הפרופיל הגנומי של השאת, שעשוי לשקף באופן פרטני מוטציות ספציפיות בגידול של חולה מסוים, שיכולות להגיב לטיפול מכוונן מטרה הפועל במסלול תאי זה. קיים שינוי תפיסתי מהבדיקה הפתולוגית הקלאסית, שבודקת חלבון או גן בודד כאתר פעולה אפשרי, לתרופה בודדת (מודל one test - one drug) לבדיקות גנומיות מורכבות שעושות שימוש בטכנולוגיות של ריצוף מהדור החדש (Next Generation Sequencing - NGS) במעבדות דיאגנוסטיות קליניות.
הטמעת מודל "רפואה מותאמת אישית גנומית" בקליניקה כרוכה באתגרים רבים, בהם:
- עלויות גבוהות לבדיקות
- סטנדרטיזציה של איכות הבדיקות (ברמת הריצוף, הפקת החומר הגנומי והיבטים טכניים כמו איסוף ואחסון הדגימות)
- סוגיות אתיות העולות כתוצאה מבדיקות גנטיות, הן פועל יוצא מתוצאות הבדיקה הגנומית. השאלה העיקרית המתבקשת וטרם התקבל עבורה מענה: האם טיפול מכוון מטרה המותאם לפרופיל המוטציות של הגידול הפרטני אכן מיתרגם לשיפור בשרידות המטופל
ההתפתחות בהבנת הביולוגיה של גידולי המעי הגס סללה את הדרך לגישה מותאמת אישית. לעומתה, הגישה המסורתית מבוססת על עדויות מחקריות לתועלת הטיפול על סמך מאפייני גידול פתולוגיים דומים בקבוצות חולים, ללא אבחנה בשוני פוטנציאלי בפרופיל הגנומי של הגידולים, שעשוי להכתיב תגובה שונה לטיפול.
הבדלים במאפיינים הגנומיים של הגידול
סרטן המעי הוא מחלה מורכבת והטרוגנית, שהאטיולוגיה שלה נעוצה במספר מסלולים תאיים אפשריים, גם נוכח מופע היסטולוגי דומה. הבדל זה בפרופיל הגנומי של הגידול שאיננו מתבטא בתצורה ההיסטופתולוגית, עשוי להסביר התפתחותו של מהלך ביולוגי שונה לאורך ציר הזמן בחולים שאצלם קיים דמיון במראה ההיסטופתולוגי של הגידול ושוני במהלך הקליני ובתגובות לטיפולים השונים[2].
פרויקט אטלס גנום הסרטן (The Cancer Genome Atlas, TCGA) הגדיר את המסלולים התאיים הבולטים המעורבים בפתוגנזה של סרטן המעי הגס - לדוגמה, ביטוי יתר של האונקוגן MYC, ושל גנים במסלול WNT, ושינויים ב-KRAS, BRAF או NRAS בשילוב עם שינויים במסלול PI3K[3]. בהמשך מופו ארבע תתי-קבוצות שונות של גידולי סרטן מעי (consensus molecular types), בעלי ביולוגיה ייחודית ומסלולים תאיים בולטים שעומדים בבסיס הפתולוגיה של כל תת-קבוצה. בין הקבוצות נצפה מהלך ביולוגי שונה, המתבטא בשינויים בשרידות הכוללת, שכיחות מוגברת של מוטציות מסוגים מסוימים ותגובה שונה לטיפולים מכווני מטרה [4], כך נמצא כי תת-קבוצה אחת מבטאת אברציות במסלול HER2 בשכיחות גבוהה יותר, בתת קבוצה אחרת שכיחות MSI-H מוגברת ודומה.
NGS - מהפכה במחקר הגנומי
הבדיקות הגנומיות בטכנולוגיות ריצוף מהדור החדש (NGS), מהוות מהפכה במחקר הגנומי, ועם חלוף הזמן ועליית זמינות בדיקות אלה הן עשויות להפוך לכלי היעיל והכלכלי ביותר לבדיקת ביומרקרים כ-MSI ו-RAS כחלק מהשגרה הקלינית הסטנדרטית, במקביל לבדיקת גנים נוספים באותו המעמד. אולם במגוון מעבדות הבדיקות אמנם נעשות בטכנולוגיה דומה, אך בשינויים מתודולוגיים. על כן, לצורך הטמעת טכנולוגיות אלה כחלק משגרת הטיפול, יש לוודא מעבר לכל ספק כי הבדיקות מאושררות ועוברות תהליך רשמי של תיקוף (ולידציה). הביואינפורמטיקה הנלווית לתהליך זה ומספקת את ניתוח הנתונים והתוצאות היישומיות של הבדיקה, מחויבת להיות ברמה גבוהה ומקצועית. רצף המוטציות המאופיינות בבדיקות NGS נע בין פנל של כמה עשרות גנים לפנל רחב של גנים הנחשבים מכוונים (targetable/ actionable) או גנים מדכאי גידול (Tumor Suppressor Genes).
בדיקות אלה מספקות כמויות מידע אדירות, אלא שברובן לא ברורה חשיבותן הקלינית, ולכן הן אינן יכולות להחליף את המערכת המקובלת להערכת יעילות הטיפול הקליני - רפואה נתמכת ראיות (Evidence Based Medicine - EBM), אלא לשמש כחלופה נוספת.
שילוב NGS עם מחקרים קליניים
שילוב מחקרים קליניים הקלאסיים עם טכנולוגיית הריצוף מהדור החדש הוא כלי עזר המסייע להגדיר במדויק את פרופיל החולים המגיבים לטיפול במחקרים הקליניים. במחקרים רבים, קיים אלמנט של מחקר תרגומי המתבסס על טכנולוגיית הריצוף מהדור החדש ומספק פרופיל גנומי לחולים המשתתפים במחקר. כך ניתן לרבד באופן מדויק יותר את הפרופיל הביולוגי של החולים ולמצוא את הקורלציה לתגובה לטיפול שתאפשר לבחור את החולים המתאימים לטיפול על סמך ביומרקרים אלה. כך לדוגמה, במחקרים שבודקים את תועלת האימונותרפיה, הוטמע אלמנט זה של ריצוף, מכיוון שטיבה הביולוגי של קבוצת החולים שמפיקה תועלת מאימונותרפיה לוט בערפל. מעבר לסטטוס מוגבר של MSI, ומחקרים המעידים על התאמה בין ריבוי מוטציות ליעילות האימונותרפיה, עדיין לא התבססו ביומרקרים נוספים מוכחים כאינדיקטורים ליעילות הטיפול. לכן, אפיון מולקולרי וגנומי של אוכלוסיית המשתתפים במחקר עשוי לשפוך אור על האוכלוסייה המגיבה לטיפול והאוכלוסייה העמידה בפניו.
NGS והעמקת המחקר התרגומי
טכנולוגיות ה-NGS מאפשרות להעמיק את המחקר התרגומי ברובד נוסף, והוא ההתחקות אחר עמידות המתפתחת לטיפול או שינוי המתפתח בביטוי הגנים במהלך הטיפולים. ניתן לבצע את ה-NGS מרקמת גידול אך גם מ"ביופסיה נוזלית" - מדנ"א גידולי (ctDNA - Circulating Tumor DNA) המופרש לזרם הדם הסיסטמי ומופק מדם החולה. באופן זה הביופסיה הנוזלית מאפשרת בדיקה זמינה ולא חודרנית, שניתן לבצע במספר מועדים על ציר הזמן הטיפולי, במטרה ללמוד על שינויים בפרופיל הגנומי העשויים לשקף מנגנוני עמידות לטיפולים מכווני מטרה, דוגמת מעכבי EGFR או HER2[5] [6] [7].
ממד נוסף הוא ההטרוגניות של הגידול, שרלוונטית גם לעניין העמידות לטיפול. ניתוח מקיף של ה-NGS מאפשר לחשוף הבדלים גנומיים משמעותיים בין גידולי מעי שונים באותו החולה עצמו. בגידולי ריאה, למשל, הוכח כי נוכחות של תת-אוכלוסייה תאית בגידול, שהיא בעלת מוטציה T790M, מנבאת תגובה פחותה למעכבי EGFR כקו טיפולי ראשון. בגידולי מעי, מוטציה ב-RAS עשויה לנבוע מתת-אוכלוסייה קטנה בגידול המקורי טרם התחלת הטיפול, או כתוצאה מתהליך מוטגנזה במהלך הטיפול מכוון המטרה במעכב EGFR. ממספר מחקרים עולה כי ניתן ללמוד על תהליך זה בעיקר מביופסיה נוזלית (ctDNA) יותר מאשר מביופסיית רקמה [8]. בבדיקות עוקבות במהלך הטיפולים עולים גם המסלולים התאיים שנלווים לפיתוח העמידות לטיפול, ומסלולים אלה מהווים אתר פעולה לטיפול התערבותי מחקרי במטרה להקטין את הסיכון להתפתחות העמידות לטיפול. כך לדוגמה בגידולים שמפתחים עמידות למעכב EGFR, השימוש במעכבי ERK או MEK עשוי להקטין את התנגודת למעכב זה [5] [9].
סיכום
ההתפתחות האדירה בחקר הביולוגיה של הסרטן, בייחוד בתחום הגנטי, האפיגנטי והמולקולרי, היא בעלת פוטנציאל רב לטיוב הטיפול בסרטן המעי ובהמשך לזיהוי מוקדם לפי ביומרקרים עתידיים, מטכנולוגיות NGS בדם ואף בצואה [10]. אפיון הפרופיל הפרטני של המטופל יאפשר לנקוט בעתיד גישה טיפולית אישית, המתבססת על ה"חותמת המולקולרית" הספציפית של הגידול. טכנולוגיות הריצוף הגנומי מספקות תמונה כוללנית על מוטציות שעומדות בבסיס הפתוגנזה של סרטן המעי הגס (driver mutations).
טכנולוגיות אלה יהפכו דומיננטיות יותר ויותר בשנים הקרובות, ככל שמחירן יוזל ומערכות האנליזה תהיינה זמינות, אמינות ומהירות יותר, ובייחוד עם הפיכתן לחלק אינטגרלי מהמחקרים הקליניים החדשים - מה שיכול לייעל את הסקת המסקנות לגבי תת-אוכלוסיות של חולים שמפיקים את מרב התועלת מהטיפול המחקרי. הדרך לרפואה מותאמת אישית עדיין רצופה מהמורות רבות, בעיקר בתיקוף של הבדיקות, במהימנות הביומרקרים המתקבלים ובשאלה אם אכן "טיפול תפור לפי מידה" מיתרגם לשיפור בשרידות החולה, כפי שהגיוני לשער מבחינה ביולוגית, אולם ההוכחה לכך עדיין אינה חד-משמעית. רפואה מותאמת אישית היא מונח הכורך בתוכו רבדים שונים - החל בפרקטיקה של התאמת טיפול לפי מרקרים ידועים ומוכחים, וכלה בטיפולים ניסיוניים שניתן להתאים לחולה לפי פרופיל המוטציות האישי שמתקבל. ריצוף מהדור החדש הוא בעל ערך רב באפיון פרופיל המוטציות של הגידול, כשבדיקה מזהה מוטציה שעשויה לאפשר לחולה להשתתף במחקר הבודק טיפול במסלול תאי זה, ללא קשר לסוג הגידול (מחקרי "סל", Basket Trials) או במצבים בהם קווי הטיפול המוכחים מוצו הוא יוכל לספק כיוון טיפולי יצירתי שעלה רק לאור תוצאות בדיקה זו.
מחקר שמבצע המכון הלאומי לסרטן בארצות הברית (National Cancer Institute), בודק אם האפיון האינדיבידואלי של פרופיל המוטציות של גידולים שונים, ומתן טיפול בהתאם לתוצאה, אכן מיתרגם לשינוי בתוחלת חייו של המטופל. עד לקבלת תשובות לשאלה מורכבת זו, רפואה מותאמת אישית מתקיימת רק באופן מוגבל, ובשילוב המתחייב עם רפואה נתמכת ראיות, המגובה במחקרים קליניים פרוספקטיביים שעדיין קובעים, את הפרקטיקה הטיפולית.
ביבליוגרפיה
- ↑ National Comprehensive Cancer Network (NCCN). NCCN Clinical Practice Guidelines in Oncology. Colon Cancer (Version 2.2017). 2017 Mar 13; National Comprehensive Cancer Network. Available from: https://www.nccn.org/professionals/physician_ gls/PDF/colon.pdf
- ↑ Deschoolmeester V, Baay M, Specenier P, et al. A review of the most promising biomarkers in colorectal cancer: one step closer to targeted therapy. Oncologist. 2010;15(7):699-731. Epub 2010 Jun 28.
- ↑ Cancer Genome Atlas Network. Comprehensive molecular characterization of human colon and rectal cancer. Nature. 2012 Jun 18;487(7407):330-7.
- ↑ Guinney J, Dienstmann R, Wang X, et al. The consensus molecular subtypes of colorectal cancer. Nat Med. 2015 Nov;21(11):1350-6. Epub 2015 Oct 12.
- ↑ 5.0 5.1 Siravegna G, Mussolin B, Buscarino M, et al. Clonal evolution and resistance to EGFR blockade in the blood of colorectal cancer patients. Nat Med. 2015 Jul;21(7):795-801. Epub 2015 Jun 1.
- ↑ Misale S, Arena S, Lamba S, et al. Blockade of EGFR and MEK intercepts heterogeneous mechanisms of acquired resistance to anti-EGFR therapies in colorectal cancer. Sci Transl Med. 2014 Feb 19;6(224):224ra26.
- ↑ Bettegowda C, Sausen M, Leary RJ, et al. Detection of circulating tumor DNA in early- and late-stage human malignancies. Sci Transl Med. 2014 Feb 19;6(224):226-232.
- ↑ Russo M, Siravegna G, Blaszkowsky LS, et al. Tumor heterogeneity and lesion-specific response to targeted therapy in colorectal cancer. Cancer Discov. 2016 Feb;6(2):147-53. Epub 2015 Dec 7.
- ↑ Montagut C, Dalmases A, Bellosillo B, et al. Identification of a mutation in the extracellular domain of the Epidermal Growth Factor Receptor conferring cetuximab resistance in colorectal cancer. Nat Med. 2012 Jan 22;18(2):221-3.
- ↑ Gonzalez-Gonzalez M, Garcia JG, Montero JA, et al. Genomics and proteomics approaches for biomarker discovery in sporadic colorectal cancer with metastasis. Cancer Genomics Proteomics. 2013 Jan-Feb;10(1):19-25.
קישורים חיצוניים
- במה עמ' 100
המידע שבדף זה נכתב על ידי פרופ' אירית בן-אהרון - המכון האונקולוגי, מרכז הסרטן ע"ש דוידוף, המרכז הרפואי רבין; הפקולטה לרפואה, אוניברסיטת תל אביב